Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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