Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf4Q9QZS2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms