Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col4a3Q9QZS0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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