Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ercc4Q9QZD4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc4Q9QZD4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms