Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnip3Q9QXT8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms