Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpsf3Q9QXK7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms