Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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