Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfmbt1Q9JMD1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms