Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd2apQ9JLQ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms