Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cabp1Q9JLK7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp1Q9JLK7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms