Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LitafQ9JLJ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms