Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsmQ9JL96 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms