Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gde1Q9JL56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gde1Q9JL56 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms