Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Habp4Q9JKS5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms