Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caln1Q9JJG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Caln1Q9JJG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms