Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms