Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Kcnip1Q9JJ57 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnip1Q9JJ57 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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