Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms