Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc22Q9JIG7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms