Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf3Q9ET30 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms