Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb3Q9ERD7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms