Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms