Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Senp3Q9EP97 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp3Q9EP97 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms