Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xab2Q9DCD2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms