Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms