Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnn3Q9DAW9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnn3Q9DAW9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn3Q9DAW9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms