Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ift43Q9DA69 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ift43Q9DA69 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift43Q9DA69 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms