Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sgf29Q9DA08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms