Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hm13Q9D8V0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hm13Q9D8V0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms