Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1qtnf2Q9D8U4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms