Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D8Q6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms