Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl17Q9D8P4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl17Q9D8P4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms