Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8L0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms