Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl4Q9D8E6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl4Q9D8E6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms