Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms