Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rep15Q9D7T1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rep15Q9D7T1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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