Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf13Q9D777 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13Q9D777 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms