Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms