Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Rab11fip1Q9D620 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Rab11fip1Q9D620 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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