Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc39Q9D5Y1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms