Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms