Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Zcchc13Q9D548 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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