Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms