Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930564D02RikQ9D4S4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms