Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms