Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam90a1bQ9D4F3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms