Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UvssaQ9D479 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms