Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D454 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D454 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D454 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms