Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx29Q9D3S3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx29Q9D3S3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms