Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms